İskenderun 35-55 kuzey enlemi ile 36-09 doğu boylamı mevkiindedir. İskenderun Körfezinin  doğusunda amanos dağları yükselmekte olup, İskenderun bu dağların  eteğinde 5 km’lik yalı ovasında kurulmuştur. Kent Halep - Belen yolu bitiminde  yer almaktadır. Aynı zamanda şiddetli lodos rüzgarlarından  batıda meydana gelen  bir burunla korunmakdadır körfezin güneyinde 6840 hektar   genişliğindeki Arsuz ovası  ile körfezin doğusunda 34920 hektar yer kaplayan ve 30 km uzunluğunda  olan İskenderun  ovası ile noktalanmaktadır.
 
          İskenderun’da yaz ve kışın sürekli olarak akan önemli bir akarsu yoktur. Kaynaklarından zıffın pınarı , kutu pınarı, Alibaba ve taşoluk pınarları bulunur. Yeraltı sularıda içme suyu olarak kullanılmaktadır.İskenderun ovasında Akçay bataklığı takriben 1 km2 alana  yayılmış olup, kotu : 0 metre civarındadır. Frenk bataklığı ise takriben 1 km.lik sahadada kotu   0,30 metredir 
 
          İskenderun’da tamamen akdeniz iklimi hüküm sürer. Yazın yüksek sıcaklık 40, en düşük sıcaklık ise 19 derece olmaktadır. Yılın 6-7 ayı yazdır. Kışlar ılık geçtiğinden ısının sıfırın altına  düştüğü görülmemiştir. Yıllık yağış ortalaması 877 mm’yi bulurken, yıllık ortalama nem miktarı 70 dolayındadır. Kentte kış ve ilk bahar aylarında güney doğu’dan zaman zaman hızı 140  km’yi bulan ve mahallen "Yarıkkaya " adı verilen  kısa süreli rüzgarlar estiğinde kentte hayat kısmen durur.